隨著新冠病毒的蔓延,*醫學研究人員都在努力尋找用于治療新冠肺炎的*藥,Atazanavir(阿扎那韋,C38 H52 N6 O7)是一種能夠有效治療SARS-CoV-2病毒的藥物。相關研究表明,Atazanavir有可能對抗新冠病毒COVID-19也具有一定的療效。2015年,ICDD-PDF數據庫收錄了Atazanavir粉末衍射圖及二維分子式(見PDF No. 00-065-1426),并于2017年修正了該物相的F因子。
僅僅知悉藥物的二維分子式,對于研究藥物對抗病毒的機理,還遠遠不夠,迫切需要解析Atazanavir的晶體結構,來深入研究該藥物對抗新冠病毒的療效顯得尤為重要。近ICDD執行主席Thomas Blanton 、PDF數據庫編輯Amy Gindhart和其合作者伊利諾伊理工學院的James Kaduk基于PDF卡片數據庫中出版的Atazanavir標準衍射卡片,共同解析出了室溫下Atazanavir的晶體結構,為醫學工作者研究新冠病毒COVID-19的治療方案提供了巨大的幫助,極大的推進了探索Atazanavir治療新冠病毒的可行性。
采用同步輻射的方法,收集了純相的Atazanavir的衍射圖,基于Rietveld精修理論,使用JADE(ICDD-MDI)軟件對其進行了指標化,Atazanavir屬于單斜晶系,空間群為P21,晶胞參數為a = 15.331, b = 5.902, c = 21.562 ?, β = 96.3°; 原胞體積為1939.3 ?3。
采用密度泛函理論(Densityfunctional theory,DFT),對Atazanavir的晶體結構能量計算進而優化晶體結構,以尋求優的晶體結構。同時結合Rietveld精修的結果,對Atazanavir晶體結構進行解析。下圖為Rietveld精修和DFT理論優化的Atazanavir晶體結構的對比,相關的均方根約為0.077 。
進一步,解析出Atazanavir的三維結構如下圖所示:
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